Biologisk mangfoldighed 

Et af de argumenter, der bliver brugt imod genteknologien, er, at teknologien kan skade den biologiske og genetiske mangfoldighed. Hvis man betragter spørgsmålet rent teoretisk, så medfører genmodificeringen faktisk en øget genetisk mangfoldighed. Mangfoldigheden bliver forøget, fordi der sker en tilførsel af et nyt gen. Men virkeligheden er imidlertid mere kompliceret.
 
Risikoscenariet er, at eksisterende, lokalt tilpassede sorter med større genetisk variation og som bliver dyrket på en mark med stor mangfoldighed af arter, forsvinder, fordi de bliver erstattet af nye, genmodificerede sorter. Man skal i den sammenhæng huske på, at næsten alle planteforædlinger ender med, at nye, forbedrede og ensartede sorter erstatter det gamle forædlingsmateriale. De nye sorter med forbedrede dyrkningsegenskaber giver et mere sikkert høstudbytte af en højere kvalitet. Hvis ikke de nye sorter giver en merværdi, ville der ikke være nogen grund for landmanden til at købe og dyrke nye sorter. Dermed ikke være sagt, at den genetiske variation, som findes i det ældre dyrkningsmateriale, er værdiløst – tværtimod! Den genetiske mangfoldighed i ældre dyrkningsmateriale skal bevares med henblik på eventuelle senere behov. Dette arbejde har stået på længe, og består af et samarbejde mellem planteforædlere og genbanker over hele verden.